Montréal, le 27 octobre 2022 — Mila, l’Institut québécois d’intelligence artificielle et Helmholtz Munich, s’unissent pour développer une modélisation causale de la cellule en formant un laboratoire international Helmholtz. L’annonce de cette nouvelle collaboration germano-canadienne a lieu le 27 octobre 2022 au siège social de Mila à Montréal.
De prestigieux invités participent à ce symposium dans le cadre d’un événement conjoint pour lancer cet ambitieux chantier. Après les allocutions de Yoshua Bengio (Mila), de Otmar Wiestler (Helmholtz Association) et de Fabian Theis (Helmholtz Munich), Mathieu Blanchette et Dhania Sridhar prendront part à une table ronde ayant pour sujet Comprendre les interactions causales des gènes régulateurs : espoirs et défis (Understanding Causal Regulatory Gene Interactions : Hopes and Challenges), suivi de présentations par des chercheurs postdoctoraux et des doctorants sur des thèmes directement en lien avec les objectifs de ce nouveau laboratoire.
De récentes percées en génomique permettent de mesurer avec une résolution sans précédent les différences cellulaires individuelles ainsi que les particularités d’une cellule dans son environnement. Il s’agit de l’une des sources de métadonnées les plus dynamiques en biologie moléculaire. L’utilisation de l’apprentissage causal pour modéliser une cellule unique permet désormais de comprendre et d’interpréter les événements de régulation des gènes selon différents paramètres biologiques. L’impact de ces nouvelles approches s'étend de la biologie des cellules souches au biomédical.
La fusion de l’expertise remarquable en apprentissage profond de Mila et des compétences bioinformatiques spécifiques à la génomique de Helmholtz permettra de modéliser la dynamique cellulaire à partir des observations de la génomique unicellulaire ainsi que les causes latentes qui gouvernent ces mécanismes.
Plus particulièrement, le but est de développer des méthodes pour comprendre les structures causales sous-jacentes afin d’expliquer la trajectoire de l’état des cellules. Cette collaboration vise l’élaboration de modèles solides de causalité de grande dimension, de comprendre les représentations profondes des réactions aux perturbations des ensembles cellulaires, et d’ajouter des a priori biologiques afin d’interpréter les résultats à l’aide de modèles entraînés en utilisant des données expérimentales comme l’épigénétique.
Citations
« Les données sont à la base de nos recherches et alimentent l'application de l'IA. Aucun esprit humain ne peut absorber des millions de points de données, mais les ordinateurs le peuvent! Nous sommes ravis de travailler avec les grandes quantités d'expertise en biodonnées et en biologie computationnelle de nos collègues Helmholtz et de combiner l'expérience de nos groupes de recherche », a indiqué Yoshua Bengio, directeur scientifique et fondateur de Mila.
« Nous souhaitons prédire les causalités importantes de diverses maladies et nous sommes très enthousiastes de travailler avec nos partenaires de Mila pour effectuer des progrès significatifs dans la recherche en IA et en biologie fondamentale », Fabian Theis, directeur de l'Institut de biologie computationnelle (Helmholtz Munich) et de Helmholtz AI.
