Lab causalité cellulaire – Une collaboration entre Mila et l’Institut Helmholtz
Combiner les expertises en intelligence artificielle (IA) pour comprendre le rôle des processus cellulaires dans le développement de maladies
Combiner les expertises en intelligence artificielle (IA) pour comprendre le rôle des processus cellulaires dans le développement de maladies
Mila et ses partenaires sont résolus à soutenir la recherche en biologie sur les cellules souches, en biomédecine et dans les domaines connexes pour répondre à certains des plus grands enjeux sanitaires mondiaux comme le cancer, le diabète et la résistance aux antimicrobiens.
Dans le cadre de ce projet, Mila s’associe à l’Institut Helmholtz-Munich et à l’Institut Max-Planck pour les systèmes intelligents pour créer un laboratoire international qui utilisera des mégadonnées et l’IA dans le but d’étudier le rôle des processus cellulaires dans le développement de maladies.
Ce projet de recherche vise à modéliser la dynamique cellulaire à partir de la génomique de cellules individuelles, de même que ses causes latentes. Notre étude nous permettra d’élaborer des méthodes causales d’apprentissage profond de représentations qui amélioreront notre compréhension des décisions cellulaires.
Plus précisément, nous aspirons à :
Élaborer de robustes inférences causales à haute dimension sur des espaces latents;
Élaborer des modèles causaux de la dynamique et des perturbations cellulaires;
Étendre les résultats à des données multiomiques par l’intégration de données biologiques antérieures.
Pour s’atteler à cet ambitieux chantier, Mila et ses partenaires ont lancé le Causal Cell Dynamics Lab. Le projet fait appel à l’alliance de leurs expertises : apprentissage profond pour Mila, bio-informatique et génomique pour Helmholtz et apprentissage causal pour l’Institut Max-Planck. L’équipe de recherche du Causal Cell Dynamics Lab dispose d’un mandat de cinq ans pour trouver les structures causales sous-jacentes expliquant le développement et les trajectoires cellulaires et élaborer des modèles qui permettront d’améliorer la réaction des cellules aux changements de leur environnement. Le laboratoire est cofinancé par l’Initiative and Networking Fund d’Helmholtz.
Cette collaboration germano-canadienne donnera naissance à des partenariats stratégiques entre des établissements de recherche de premier plan et fournira des occasions de mobilité, de renforcement des relations et de réseautage à l’international à des chercheur·euse·s de renommée mondiale et à de jeunes talents doctoraux.
Notre consortium diversifié travaillera à l'intersection de l'IA et de la génomique. Cela nous aidera non seulement à prédire les causes importantes de diverses maladies, mais aussi à réaliser des avancées significatives dans le domaine de l'IA et de la recherche en biologie fondamentale.
Le Causal Cell Dynamics Lab est une collaboration entre Helmholtz Munich, l'Institut Max Planck pour les systèmes intelligents et Mila.
Pour toute question sur le projet, veuillez contacter Mathieu Seyfrid (mathieu.seyfrid@helmholtz-muenchen.de), gestionnaire de programmes chez Helmholtz.