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Amin Emad

Membre académique associé
Professeur adjoint, McGill University

M. Emad est professeur adjoint au département de génie électrique et informatique de l’Université McGill. Il est également affilié à l’Institut du cancer Rosalind et Morris Goodman, à l’initiative McGill en médecine computationnelle (MiCM), au programme des sciences quantitatives de la vie (QLS) et aux Laboratoires Meakins-Christie de l’Université McGill. Il est également membre associé de l’Institut québécois d’intelligence artificielle (Mila). Avant de se joindre à McGill, il était associé de recherche postdoctorale au centre d’excellence KnowEnG du NIH en informatique des grandes données, associé au département d’informatique et à l’Institut de biologie génomique (IGB) de l’Université de l’Illinois à Urbana-Champaign (UIUC). Il a obtenu son doctorat à l’UIUC en 2015, sa maîtrise à l’Université de l’Alberta (UofA) en 2009 et sa licence à l’Université technologique Sharif (SUT) en 2007. Ses recherches se situent à l’intersection de l’IA et de la biologie informatique.

Publications

2021-08

RAPPPID: Towards Generalisable Protein Interaction Prediction with AWD-LSTM Twin Networks
Joseph Szymborski and Amin Emad
bioRxiv
(2021-08-15)
www.biorxiv.orgPDF
Looking at the BiG picture: Incorporating bipartite graphs in drug response prediction
David Earl Hostallero, Yihui Li and Amin Emad
bioRxiv
(2021-08-12)
www.biorxiv.orgPDF

2021-07

A Deep Learning Framework for Prediction of Clinical Drug Response of Cancer Patients and Identification of Drug Sensitivity Biomarkers using Preclinical Samples
Hostallero De, Wei L, Wang L, Cairns J and Emad A
bioRxiv
(2021-07-07)
europepmc.orgPDF

2021-03

A network-informed analysis of SARS-CoV-2 and hemophagocytic lymphohistiocytosis genes' interactions points to Neutrophil extracellular traps as mediators of thrombosis in COVID-19.
Jun Ding, David Earl Hostallero, Mohamed Reda El Khili, Gregory Joseph Fonseca, Simon Milette, Nuzha Noorah, Myriam Guay-Belzile, Jonathan Spicer, Noriko Daneshtalab, Martin Sirois, Karine Tremblay, Amin Emad and Simon Rousseau
PLOS Computational Biology
(2021-03-08)
europepmc.org

2021-02

Inference of phenotype-relevant transcriptional regulatory networks elucidates cancer type-specific regulatory mechanisms in a pan-cancer study
Amin Emad and Saurabh Sinha
npj Systems Biology and Applications
(2021-02-08)
www-nature-com-443.webvpn.bjmu.tsg211.com

2020-12

Identification of COVID-19-relevant transcriptional regulatory networks and associated kinases as potential therapeutic targets
Chen Su, Simon Rousseau and Amin Emad
bioRxiv
(2020-12-23)
search.bvsalud.orgPDF

2020-10

A recursive framework for predicting the time-course of drug sensitivity.
Cheng Qian, Amin Emad and Nicholas D. Sidiropoulos
Scientific Reports
(2020-10-19)
www.nature.com

2020-08

Distinct miRNA Profile of Cellular and Extracellular Vesicles Released from Chicken Tracheal Cells Following Avian Influenza Virus Infection.
Kelsey O’Dowd, Mehdi Emam, Mohamed Reda El Khili, Amin Emad, Eveline M. Ibeagha-Awemu, Carl A. Gagnon and Neda Barjesteh
Vaccine
(2020-08-05)
www.ncbi.nlm.nih.govPDF

2020-07

Superior breast cancer metastasis risk stratification using an epithelial-mesenchymal-amoeboid transition gene signature
Amin Emad, Tania Ray, Tor W. Jensen, Meera Parat, Rachael Natrajan, Saurabh Sinha and Partha S. Ray
Breast Cancer Research
(2020-07-08)
breast-cancer-research.biomedcentral.comPDF
A network-informed analysis of SARS-CoV-2 and hemophagocytic lymphohistiocytosis genes’ interactions points to Neutrophil Extracellular Traps as mediators of thrombosis in COVID-19
Jun Ding, David Earl Hostallero, Mohamed Reda El Khili, Gregory Fonseca, Simon Millette, Nuzha Noorah, Myriam Guay-Belzile, Jonathan Spicer, Noriko Daneshtalab, Martin Sirois, Karine Tremblay, Amin Emad and Simon Rousseau
medRxiv
(2020-07-02)
www.medrxiv.orgPDF

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